Ni siquiera un hecho tan devastador como la Guerra Civil Española impidió que se continuaran celebrando los Sorteos de la Lotería Nacional y el ya especial Sorteo de Navidad. Eso sí, como no podía ser de otra manera, también la Lotería sufrió la división del país y cada bando continuó organizando sus propios sorteos de Lotería.
Las bombas no consiguieron liquidar las ilusiones de los españoles por conseguir el Gordo...aunque claro, también hay que tener en cuenta que no dejaba de ser una importante fuente de ingresos para el Estado, especialmente ante la situación de guerra civil del país. Se calcula que los ingresos supusieron aquellos años más del 1% del PIB (aproximadamente el 3% de los ingresos estatales).
Ambos bandos vieron en la Lotería una oportunidad para obtener beneficios para continuar su contienda, por lo que se celebraron dos sorteos. Curiosamente, ambos usaron el mismo nombre "Lotería Nacional". Entre otros motivos, si alguno de los bandos hubiese cambiado el nombre usado hasta la fecha, hubiese supuesto el reconocimiento explícito e inmediato del oponente.
Durante los años que duró la guerra, las sedes de los sorteos fueron cambiando. En la zona republicana fueron Madrid, Valencia y Barcelona (en este orden), mientras que en la zona nacional fueron en Sevilla y Burgos.
Poco después del sorteo de Navidad de 1939, concretamente el 21 de enero de 1939, se celebró el último sorteo en Barcelona cuya lista de premios no llegó a publicarse nunca debido a la toma de la ciudad.